Die Fahnenarbeit kann zu Beginn jeder Trainingseinheit hinzugenommen werden. Sie hilft, die Kopfgelenke zu mobilisieren, fördert die Konzentration und dient der Entspannung. Durch die Farbreize und Fokussierung auf die Fahne ist sie besonders für aufgeregte Pferde geeignet. Das Pferd wird ins hier und jetzt geholt, die Aufmerksamkeit ist beim Mensch und es kann Außenreize dadurch besser ausblenden. Man kann sie zu Beginn einer Trainingseinheit durchführen, um das Genick zu lockern. So kann man losgelassen und konzentriert in die Trainingseinheit einsteigen.
Die Fahnenarbeit integriert auch die Positionsarbeit, denn auch hier sollte sich das Pferd vom Menschen führen lassen. Vor allem ängstliche und aufgeregte Pferde profitieren davon. Durch das Hin- und Herschwenken der Fahne folgt das Pferd mit den Augen und die Informationen werden im Gehirn verarbeitet. Diese Methode nutzt man auch in der Traumatherapie bei Menschen.
Bei Pferden kann man sie zum Beispiel als Hilfestellung beim Verladetraining nutzen.